หลังจากเหตุการณ์หายนะในศูนย์ทดลอง The Hive ในภาคแรก ไวรัสมรณะจาก Umbrella Corporation ได้แพร่กระจายสู่เมืองแร็คคูนซิตี้ ทำให้ประชากรจำนวนมากกลายเป็นซอมบี้ อลิซ ฟื้นคืนสติขึ้นมาในโรงพยาบาลร้าง และพบว่าทั้งเมืองถูกปิดตาย เธอจึงต้องรวมตัวกับกลุ่มผู้รอดชีวิตที่เหลือ รวมถึง จิล วาเลนไทน์ เจ้าหน้าที่ S.T.A.R.S. ที่มีทักษะการต่อสู้ไม่แพ้กัน เพื่อหาทางหนีจากเมืองที่กลายเป็นแดนมรณะ

ในขณะที่การเอาชีวิตรอดกลายเป็นเรื่องยากขึ้นทุกที พวกเขาต้องเผชิญกับศัตรูใหม่ที่ร้ายกาจยิ่งกว่าเดิม นั่นคือ เนเมซิส อาวุธชีวภาพรุ่นล่าสุดของ Umbrella ที่ถูกส่งมาเพื่อไล่ล่าพวกเขาโดยเฉพาะ ภารกิจของอลิซจึงไม่ใช่แค่การเอาตัวรอด แต่ยังต้องเปิดโปงความลับและหยุดยั้งการแพร่ระบาดของไวรัสร้ายให้ได้ก่อนที่ทุกอย่างจะสายเกินไป