พุซ อิน บู๊ทส์ กลับมาแล้ว! แต่คราวนี้เขาต้องเผชิญกับเรื่องที่หนักหน่วงกว่าการต่อสู้กับยักษ์หรือมังกร นั่นคือ… การตาย หลังจากใช้ชีวิตอย่างประมาทมาตลอด พุซก็ค้นพบว่าเขาเหลือชีวิตอยู่แค่ชีวิตเดียวจากเก้าชีวิต ความกลัวตายทำให้เขาต้องซ่อนตัวจากการผจญภัย จนกระทั่งได้ยินเรื่องราวของ “ดาวอธิษฐาน” ที่สามารถทำให้ความปรารถนาใดๆ เป็นจริงได้

การเดินทางครั้งนี้ไม่ใช่แค่การหาสมบัติ แต่เป็นการเดินทางค้นหาตัวเอง พุซต้องร่วมมือกับคิตตี้ ซอฟต์พอว์ส อดีตคู่หูที่เขาทรยศ และเปอร์โร่ หมาจรจัดใจดี เพื่อแย่งชิงดาวอธิษฐานจากคู่แข่งที่อันตรายหลายฝ่าย ทั้งแจ็ค ฮอร์เนอร์ นักสะสมเวทมนตร์ผู้โลภโมโห และครอบครัวหมีสามตัวที่กลายเป็นนักฆ่าระดับโปร แต่ที่น่ากลัวที่สุดคือ “หมาป่า” ตัวตายที่คอยตามล่าพุซไม่เว้นวัน