หลังจากเชื้อไวรัสที่มนุษย์สร้างขึ้นได้คร่าชีวิตประชากรไปเป็นจำนวนมาก โลกตกอยู่ในความโกลาหล ซีซาร์และเหล่าวานรที่มีพัฒนาการทางสติปัญญาสูงได้สร้างอาณาจักรของตนเองขึ้นในป่าอย่างสงบสุข แต่ความสมดุลเริ่มถูกสั่นคลอนเมื่อกลุ่มมนุษย์ผู้รอดชีวิตที่เหลืออยู่ในซานฟรานซิสโกพยายามสร้างสังคมขึ้นมาใหม่ และจำเป็นต้องใช้พลังงานจากเขื่อนที่ตั้งอยู่ในเขตอาณาจักรวานร

ความตึงเครียดระหว่างมนุษย์และวานรทวีความรุนแรงขึ้น เมื่อการเจรจาไม่อาจนำไปสู่ความเข้าใจได้ ต่างฝ่ายต่างเต็มไปด้วยความหวาดระแวงและความไม่ไว้วางใจ ซีซาร์พยายามอย่างยิ่งที่จะรักษาสันติภาพ แต่การถูกหักหลังจากภายในกลุ่มวานรเองกลับกลายเป็นชนวนที่จุดประกายสงครามครั้งใหญ่ที่ไม่อาจหลีกเลี่ยงได้