วัยหนุ่ม 2544 เล่าเรื่องราวของกลุ่มวัยรุ่นชายในยุคปี 2544 ซึ่งเป็นช่วงเวลาสำคัญในชีวิตที่เต็มไปด้วยความฝัน มิตรภาพ และการค้นหาตัวตน ผ่านมุมมองของ “ปิง” เด็กหนุ่มมัธยมปลายที่ใช้ชีวิตร่วมกับกลุ่มเพื่อนชายสุดซี้ในโรงเรียนประจำจังหวัดเล็กๆ พวกเขาต่างเผชิญกับปัญหาส่วนตัวและความสับสนในวัยเยาว์ ทั้งในเรื่องของความรัก เพศสภาพ และอนาคตที่ยังไม่แน่นอน

เรื่องราวดำเนินไปท่ามกลางบรรยากาศยุค 2000 ที่เต็มไปด้วยกลิ่นอายของวัฒนธรรมป๊อป เพลงเก่า เครื่องเล่นวอล์กแมน โทรศัพท์มือถือจอขาวดำ และเสื้อผ้าสไตล์ Y2K ซึ่งกลายเป็นสื่อกลางในการสะท้อนความทรงจำของผู้ชมที่เติบโตมาในช่วงเวลานั้น ในขณะเดียวกัน หนังก็เปิดพื้นที่ให้เห็นความอ่อนไหวทางอารมณ์ของตัวละครที่ค่อยๆ เติบโตผ่านบทเรียนชีวิตต่างๆ