ในภารกิจลับสุดอันตรายที่เกี่ยวข้องกับองค์กรไฮดราและวายร้ายหุ่นยนต์ผู้ทรงพลังอย่างเรดสกัลล์และทาสค์มาสเตอร์ ไอรอนแมน และกัปตันอเมริกาจำเป็นต้องรวมพลังกันเพื่อหยุดยั้งแผนร้ายที่จะเปลี่ยนเหล่าทหารให้กลายเป็นซูเปอร์โซลเยอร์ที่ควบคุมโดยศัตรู การร่วมมือระหว่างสองซูเปอร์ฮีโร่ที่มีบุคลิกแตกต่างกันสุดขั้วกลายเป็นจุดแข็งที่สามารถพลิกสถานการณ์และยับยั้งภัยคุกคามระดับโลก

เมื่อทาสค์มาสเตอร์สามารถขโมยเทคโนโลยีอาร์ครีแอคเตอร์จากไอรอนแมนได้สำเร็จ พร้อมกับการจับตัวกัปตันอเมริกาเพื่อใช้ดีเอ็นเอสร้างกองทัพใหม่ ไอรอนแมนต้องฝ่าด่านอุปสรรคมากมายเพื่อช่วยเพื่อนร่วมรบกลับมา และในขณะเดียวกัน กัปตันอเมริกาต้องใช้ความกล้าหาญและไหวพริบเพื่อเอาชีวิตรอดก่อนจะสายเกินไป ภารกิจครั้งนี้จึงเป็นการพิสูจน์ความไว้วางใจและพลังของทีมเวิร์กอย่างแท้จริง